L’Abat del monestir de Banyoles, el 13 de novembre de 1583, cedí l’ermita de sant Martirià (patró de la població) als framenors caputxins qui, després d’alguns decennis de vida eremítica, hagueren d’abandonar la fundació, el 8 de gener de 1638, per les males condicions higièniques de l’indret on sojornaven.

La població de Banyoles ha mantingut una activa i nombrosa fraternitat franciscana seglar que, l’any 1884, reorganitzà i potencià el P. Xavier d’Arenys de Mar.